针对农村地区普九欠债长期困扰政府正常办学的问题，国务院开始了清理化解农村义务教育普九欠债的试点工作。决定从2007年12月起，用两年左右的时间，基本完成普九债务的还款工作。同时，针对媒体上不断报道的农村中小学卫生安全事故屡有发生的情况，启动了“新农村卫生新校园建设”工程，一揽子解决农村中小学卫生和饮水难的问题。
“让所有孩子都能上得起学，上好学”，是中国政府推进教育公平的坚定承诺。在义务教育阶段，城乡孩子应该平等享有接受教育的权利。为此，2008年春天，我国在16个省份和5个计划单列市进行免除城市义务教育学杂费试点。据统计，在这项试点工作中，共有1702万名城市义务教育阶段学生免除了学杂费，占全国城市义务教育阶段学生总数的60%。中国的义务教育在新的起点上做出了让民众满意的新成绩。2008年秋季学期起，免除城市义务教育阶段学杂费在全国范围内实施，惠及全国2.59万所城市中小学的2821万学生。据《2008年全国教育事业发展统计公报》的数据，2008年，全国教育经费为14500.74亿元，比上年增长19.37%。其中，国家财政性教育经费（包括国家财政预算内教育经费、各级政府征收用于教育的税费、企业办学中的企业拨款、校办产业和社会服务收入用于教育的经费）为10449.63亿元，比上年增长26.20%。普通中小学校办学条件进一步改善。全国普通中小学校舍建筑面积136521.37万平方米。小学体育运动场（馆）面积达标校数的比例为55.88%，体育器械配备达标校数的比例为50.61%，音乐器械配备达标校数的比例为46.31%，美术器械配备达标校数的比例为44.97%，数学自然实验仪器配备达标校数的比例为54.70%。普通初中体育运动场（馆）面积达标校数的比例为69.3%，体育器械配备达标校数的比例为66.9%，音乐器械配备达标校数的比例为60.27%，美术器械配备达标校数的比例为59.15%，理科实验仪器配备达标校数的比例为73.51%。